王旭东说，“我们现在招生里面叫实施阳光招生工程，就是你如果能够把你的招生条件、你的招生程序、你的招生的信息、录取的结果等等，你都公开化，晒出来，接受社会的监督，很多问题都可以解决。阳光了，腐败也就没有了。”
2013年9月，中央第十巡视组向中国人民大学反馈巡视情况，提出人民大学在自主招生等方面存在薄弱环节。同年11月，人民大学招生就业处原处长蔡荣生接受有关纪检部门的调查。人大随后暂缓自主招生一年。该事件引起舆论轩然大波。
曾有网民认为，每到年初全国各地有名的重点一本、二本高校自主招生时，高三学生家中就到处找关系，不惜花钱为的是搞有名的重点一本、二本高校自主招生录取指标，自主招生制度应该立即废除。
对此，王旭东表示，自主招生是发展方向，不能因为当下有少数学校在自主招生方面出了问题，就否定自主招生的方向。
王旭东指出，要解决自主招生过程中存在的腐败问题，高校本身要提升自己自主办学的能力，比如自主招生权给了你，你怎么能够把这个权行使好，这是一种自己的能力。另外一个方面，还在于制度的健全。
“这需要一个过程。这个过程中有阵痛，这个过程中要交点学费，这是在所难免的，但是这是一个趋势。”王旭东说。
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